พ.ศ.2499 กรมศิลปากรได้แต่งพระปรางค์ ได้พบห้องใต้ดินใต้ห้องเรือนธาตุของพระปรางค์ พบตลับทองรูปปลาภายในบรรจุสิงโตทองคำ ด้านล่างห้องพบ ผอบศิลาบรรจุพระบรมสารีริกธาตุ ภายในมีเจดีย์ซ้อนกัน 6 ชั้น ชั้นในสุดบรรจุพระบรมสารีริกธาตุ ปัจจุบันเก็บรักษาและประดิษฐานอยู่ ณ พิพิธภัณฑสถานแห่งชาติ เจ้าสามพระยา