โครงงานเรื่องการศึกษาความหลากหลายของไดอะตอมที่เป็นดัชนีคุณภาพน้าในลุ่มแม่น้ำโขง จังหวัดมุกดาหารมีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ของความหลากหลายของไดอะตอมกับคุณภาพน้ำเพื่อใช้ไดอะตอมเป็นตัวชี้วัดคุณภาพน้าต่อไป โดยศึกษาจากตัวอย่างไดอะตอมที่ได้จากการเก็บตัวอย่างบริเวณต้นน้ำแม่น้าสายรองของแม่น้ำโขงแล้วน้าข้อมูลที่ได้มาเปรียบเทียบกับข้อมูลคุณภาพน้ำที่ได้จากกลุ่มโครงงานกลุ่มโครงงานการศึกษา ประเมินผล การใช้สารเคมีป้องกันและก้าจัดศัตรูพืชที่มีต่อสิ่งแวดล้อมทั้งแหล่งน้ำและดิน ปรากฎว่าความหลากหลายของไดอะตอมมีความสัมพันธ์กับคุณภาพน้ำในทิศทางเดียวกัน