หลังนี้สร้างด้วยไม้ ลักษณะเป็นทรงโถงจตุรมุข อันเป็นเอกลักษณ์แห่งเดียวในประเทศไทย เป็นสถาปัตยกรรมเก่าแก่ ซึ่งตรงกลางของวิหารประดิษฐานพระพุทธรูปสี่องค์ หลังคาซ้อนกันสามชั้นซึ่งตกแต่งไว้อย่างสวยงาม รวมไปถึงเสาสี่เหลี่ยมทีก็มีลวดลายอันน่าวิจิตร และบริเวณด้านบนรอบตัววิหารนั้นได้รับการประดับด้วยพระพุทธรูปองค์เล็กจำนวนมากถึง 1,080 องค์ นี่จึงเป็นที่มาของชื่อ วิหารพันองค์ ที่ใช้เรียกกันอย่างติดปาก
นอกจากนี้ยังมีพระเจดีย์ศรีจอมไคล วิหารพระนอน เสาหงส์ หีบธรรมโบราณสำหรับใส่คัมภีร์พระไตรปิฎก ธงช้างเผือกขนาดใหญ่ในสมัยรัชกาลที่ 6 และยังมีพิพิธภัณฑ์ข้าวของเครื่องใช้สมัยโบราณให้เยี่ยมชมกันอีกด้วย