โดยเอนไซม์จากจุลินทรีย์จะทำให้ปฏิกิริยาการย่อยเกิดภายใต้สภาวะที่ไม่รุนแรง คือที่อุณหภูมิประมาณ 50°C ความดันบรรยากาศ เพราะเอนไซม์มีความจำเพาะเจาะจงต่อสารประกอบเซลลูโลสมาก ทำให้ไม่สูญเสียกลูโคสระหว่างเกิดปฏิกิริยาและไม่เกิดผลิตภัณฑ์ที่ไม่ต้องการ ข้อดีของการย่อยสลายด้วยเอนไซม์ ทำให้ประหยัดต้นทุนในการผลิต เนื่องจากเอนไซม์เร่งปฏิกิริยาในการทำงานได้แบบไม่ต้องใช้ความร้อน เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาได้เร็วกว่าปฏิกิริยาที่ไม่มีเอนไซม์ ผลผลิตจากปฏิกิริยาที่ได้มีความบริสุทธิ์ ไม่เกิดปฏิกิริยาข้างเคียง เนื่องจากเอนไซม์มีความจำเพาะ